Pada 2011 tim arkeologi secara resmi melaksanakan penelitian dan ekskavasi, penemuan awal yang menarik dari penelitian ini adalah bahwa struktur teras di Gunung Padang tidak hanya merupakan hasil akumulasi batuan alami melainkan juga mengindikasikan adanya campur tangan manusia yang terlibat.
Masih banyak hal yang harus ditelusuri dalam upaya untuk mengungkap sejarah dan fungsi sebenarnya Gunung Padang sehingga penelitian lebih lanjut menjadi sangat penting, perlu diperhatikan bahwa upaya penelitian terus berlanjut dalam menyingkap misteri dibalik Gunung Padang seiring dengan pemahaman yang sedang dikembangkan mengenai sejarahnya.
Tersebutlah beberapa teori yang telah diusulkan mengenai asal usul situs ini namun belum tercapai sebuah kesepakatan yang merakyat.
Berikut 4 teori yang telah diusulkan mengenai sejarah dan asal-usul situs Gunung Padang, sebagaimna dikutip HALOYOUTH dari berbagai sumber.
1. Situs Pemakaman Kuno
Pada awalnya Gunung Padang dilihat oleh beberapa ahli sebagai tempat pemakaman purba yang terbentuk sekitar 5000 tahun silam, namun keberadaan temuan-temuan baru memberi indikasi bahwa situs ini mungkin jauh lebih usang dari yang diperkirakan sebelumnya.
2. Kuil Kuno