Beberapa lokasi terkenal di Raja Ampat seperti, Kabui Passage (lorong yang sangat sempit antara Waigeo dan Pulau Gam), Dermaga Pulau Arborek, Sawandarek, Yenbuba dan Dinding Friwenm.
Mengutip dari situs resmi Raja Ampat Geopark, Raja Ampat terdiri dari total ada 2.713 pulau, 7 cagar alam, 5 kawasan konservasi perairan daerah, dan 2 suaka laut nasional.***